员工承诺书的签署程序应当包括以下几个步骤：
制定承诺书内容：首先，管理者需要确定员工承诺书的具体内容，包括员工的责任、权利、行为规范等方面的要求。
与员工沟通：在签署员工承诺书之前，管理者应当与员工进行沟通，解释承诺书的内容和意义，确保员工理解并接受其中的规定。
签署承诺书：员工和管理者双方应当在承诺书上签字确认，表示员工已经阅读并同意其中的规定，并愿意承担相应的责任。
归档备份：签署完员工承诺书后，管理者应当将承诺书归档备份，便于日后查阅和管理。
定期复核：管理者应当定期复核员工承诺书的执行情况，及时发现问题并采取相应的措施。
在实际操作中，可以结合具体的案例来说明员工承诺书的签署程序。例如，某公司制定了员工承诺书，要求员工保守公司机密，不得私自泄露。在签署承诺书时，公司通过内部培训和讨论会的形式向员工解释了保密的重要性，并要求他们签署承诺书。之后，公司定期对员工进行保密意识培训，同时定期审查员工对保密的遵守情况，确保员工承诺书的执行效果。